一、香气区别
有烟正山小种与无烟正山小种的区别在于有烟正山小种带有“桂圆干香气”，而无烟正山小种则无此香气。原因是有烟正山小种在使用传统制作方法加工时，添加了“烟熏”这道工序。而无烟小种在使用传统制作方法加工时，取消了“烟熏”这道工序。
二、加工方法区别
有烟正山小种是使用传统的制作方法加工，而其中最重要的一道工序就是“烟熏”。“烟熏”制作过程，经过发酵后的正山小种，就会放在木架的竹筛上，然后，在竹筛的下面用松木熏烤，这方法能使松木的松脂香被茶叶吸收，最后出来的烟熏小种就拥有明显的“桂圆干香气”。
三、无烟小种的由来
因为人们提高了环保意识及茶的制作工艺，所以越来越多的正山小种制作工艺中都取消了这道松脂烟熏工序。无烟小种就是从人们增强的环保意识中及提高的制作工艺中后而来。
