福建农林大学叶乃兴教授课题组联合福州海关技术中心——利用 SNP 标记构建茶树品种资源分子身份证

茶树（Camelliasinensis(L.)O.Kuntze），为多年生异花授粉植物，具有高度异质性和杂合性。中国西南地区是茶树的起源地，茶树从起源地向中国其他地区和国外的自然传播和人为传播过程中，积累了自然演化和人工选择的变异，从而在各茶区形成了丰富的茶树品种资源。然而在茶树品种资源的大量引种及频繁的品种资源交换过程中，造成同名异物、同物异名的现象，不仅给茶树品种资源保护利用带来诸多困难，也损害了消费者的权益。因而科学准确地区分和鉴定茶树品种资源具有重要意义。

  

2021年4月27日，福建农林大学叶乃兴教授课题组联合福州海关技术中心在《中国农业科学》发表了题为“利用SNP标记构建茶树品种资源分子身份证”的研究论文。该研究通过收集国内外103份茶树种质，利用SNP标记并结合茶树品种资源基本信息构建茶树品种资源分子身份证。该研究可为茶树品种资源保护鉴定提供一种新思路。

课题组前期从国家生物信息中心（nationalcenterofbiotechnologyinformation，NCBI）的数据库（http://www.ncbi.nlm.nih.gov/）中下载了茶树的表达序列标签（expresssequencetags，EST），获得大量可用于数据挖掘的高质量EST。经装配、选择，最终筛选出用于茶树种质资源的96个SNP标记位点。通过对茶树品种资源的候选SNP位点的多态性信息进行分析，剔除10个不具多态性的位点，剩余86个SNP位点。之后对茶树SNP标记多态性进行统计分析，并进行组合筛选，得到24个SNP位点，构建了茶树SNP指纹图谱，可区分全部103份茶树品种资源。SNP位点的多态性分簇读取如图1，DNA指纹图谱如图2.

  

图1茶树SNP位点多态性读取图（部分）

  

图2茶树品种资源SNP指纹图谱（部分）

对筛选获得的最佳SNP位点组成的指纹图谱进行数字编码，得到24位分子身份证基本信息。再将茶树品种资源信息编码，得到4位数字的分子身份证品种信息。将茶树品种资源基本信息和DNA指纹图谱信息结合，构建28位数字编码的茶树品种资源分子身份证。以福鼎大白茶为例，其分子身份证为1353131132311121332112313231（图3-A），将其转化为条形码和二维码如图3-B所示。其他品种资源如铁观音、黄旦、龙井43等分子身份证如表1所示。

  

图3福鼎大白茶分子身份证

  

茶树品种分子身份证条形码及二维码（部分）

该研究筛选出24个最佳SNP位点组合，可精准区分全部103份供试茶树野生种、地方品种和地方种质、优良品种、新选品系和株系以及国外品种，并使每份茶树具有唯一的分子身份证。该研究结果对于茶树品种资源区分和精准鉴定、分子数据数字化建立具有重要的意义和实际应用价值，为茶树品种资源DNA分子身份证的构建提供了思路。

福建农林大学园艺学院茶学硕士生樊晓静为第一作者。

福建农林大学园艺学院叶乃兴教授和福州海关技术中心高级农艺师于文涛博士为该论文的共同通讯作者。

福州海关技术中心蔡春平研究员、南京农业大学房婉萍教授、武夷学院张见明高级农艺师、福建农林大学茶学硕士生林浥、王泽涵也参与了该项研究。

该研究在中国乌龙茶产业协同创新中心专项、海关总署科技项目、福建农林大学茶产业链科技创新与服务体系建设等项目的资助下完成。

来源：茶叶前沿动态， 樊晓静 ，信息贵在分享，如涉及版权问题请联系删除