福建农林大学等中外科学家成功破解铁观音基因组与茶树演化史

茶是世界重要的饮料作物,以迷人的香气与多种有益健康的多酚化合物而深受广大消费者的喜爱。然而其滞后的基因组学研究极大限制了利用分子生物学技术进行优良性状的快速选育。随着第一个茶树全基因组的测序完成,围绕茶树的研究如雨后春笋般相继涌出,但乌龙茶系列最具代表性的品种“铁观音”的基因组图谱尚未破译,且茶树的遗传和演化历史仍值得进一步探究。

2021年7月15日,在福建农林大学尤民生教授和张兴坦研究员共同主持下,福建农林大学联合国内外多家单位的科学家,共同合作,破解了铁观音基因组以及茶树演化史,该论文发表于国际顶级期刊《自然遗传学》(NatureGenetics)。课题组利用独立开发的新算法攻克高杂合、高重复铁观音基因组组装难题,在此基础上阐述了等位基因不平衡、茶树群体演化和驯化等相关科学问题。

该研究团队一是利用独立开发算法成功攻克高杂合、高重复铁观音基因组组装难题,拼接了两套铁观音基因组;二是基于铁观音分型基因组组装鉴定到14691个基因具有等位变异,通过分析显示在无性繁殖的茶树基因组中,显性效应可能是其应对遗传负荷的重要机制;三是通过对161个茶树品种和15个近缘种进行重测序分析等发现大叶茶与小叶茶存在不同的演化和驯化历史。

该研究由福建农林大学、深圳基因组所等多家单位合作完成。深圳基因组所张兴坦研究员、福建农林大学硕士研究生陈帅、福建省农科院水稻所施龙清博士、中国农科院烟草研究所龚达平副研究员为论文共同第一作者,福建农林大学尤民生教授、唐海宝教授和深圳基因组所张兴坦研究员为共同通讯作者。参与该项目的人员还包括福建农林大学叶乃兴、王海峰教授,赵茜、马晓开博士,研究生张晟铖、廖振阳、王鹏杰、石岩、王毅斌、余嘉鑫、徐鑫丹、齐睿、王文玲、马昀然、马东娜、林京、魏柳锋、马亚影、李若愚、何海芳,杭州开泰生物技术公司詹东亮,加拿大布洛克大学LietteVasseur教授,福建省农科院茶叶研究所孔祥瑞、江西省农科院桑茶研究所胡桂萍博士,中南林业科技大学张琳教授,美国伊利诺伊大学香槟校区RayMing教授,中科院西双版纳热带植物园王刚研究员。

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